В чем pазница между /dev/cua* и /dev/ttyS*?

Hе надо пользовать cua*. То есть вообще. Они в ядре - только для обратной совместимости со схемой, принятой в BSD. В BSD /dev/cuXX -- это "Call Up" порты, т.е. для исходящих звонков -- на них всегда есть CD. В Linux /dev/cuaXX не применяется и новые ядра даже выдают предупреждение.